Das Heiligtum der Kybele, eines der frühesten und wichtigsten Heiligtümer des antiken Mytilene, befindet sich im heutigen Gebiet von Epano Skala, genauer gesagt in der Merarchia-Archipelagous-Straße, auf dem Gelände des ehemaligen Hospizes „Asylo Aniaton“. In der Antike muss man sich seine Lage in der Nähe des Ostufers des Euripos (Meeresenge), südlich des nördlichen Handelshafens der Stadt und östlich der archaischen Nekropole vorstellen.
Der Standort des Heiligtums wurde zwischen 1972 und 1973 bei Ausgrabungsarbeiten im Zusammenhang mit der Erweiterung des damaligen Hospizes „Asylo Aniaton“ von Mytilene entdeckt. Die ersten Rettungsausgrabungen des Archäologischen Dienstes dauerten bis 1978, während weitere Ausgrabungen zwischen 2010 und 2015 von der Ephorie für Altertümer von Lesbos, im Rahmen des Projekts zur „Vereinheitlichung der archäologischen Stätten der Stadt von Mytilene“ (ESPA-Förderprogramm 2007-2013) durchgeführt wurden.
Die architektonischen Überreste und beweglichen Funde, die in dem Gebiet gefunden wurden, stammen aus der geometrischen Zeit bis zur Spätantike. Am wichtigsten ist das ellipsenförmige Gebäude (7. Jh. v. Chr.) mit den Maßen 13,4 x 5,7 m im Osten, das in archaischer Zeit repariert wurde, wie die Verwendung von anderem (lesbischem) Mauerwerk an der Ostwand belegt. Es handelt sich um ein längliches, in N-S-Richtung ausgerichtetes Kultgebäude mit zwei Bögen an den Schmalseiten, die in Fragmenten erhalten sind. Ein großer Teil davon wurde durch den Bau späterer Gebäude aus römischer Zeit zerstört. An der Wand eines solchen Gebäudes wurde eine kopflose Statue einer thronenden Kybele (530-500 v. Chr.) mit einem Löwen auf ihrem „Schurz“ gefunden, die als Bauelement verwendet wurde; ein Fund von entscheidender Bedeutung für die Identifizierung des Heiligtums. Die reichlich vorhandene örtliche, graue, äolische Keramik, die zerbrochenen Vasen sowie die tönernen Opferbänke mit starken Brandspuren, die vor dem Haupteingang im Inneren des Gebäudes gefunden wurden, bestätigen dessen kultischen Charakter. Das Heiligtum wurde durch einen Brand zerstört (Ende des 6. – Anfang des 5. Jh. v. Chr.), wahrscheinlich im Rahmen der von Herodot (6.31) beschriebenen persischen Invasion.
Östlich des ellipsenförmigen Gebäudes wurde ein großer Teil einer Stützmauer freigelegt, die aus der gleichen Zeit stammt (Archaik). Es handelt sich um eine sorgfältig ausgeführte Konstruktion, die für das epochale lesbische Bauwerk repräsentativ ist und eine Höhe von 2 m aufweist.
Im zentralen und westlichen Teil der Stätte wurden architektonische Überreste archaischer, klassischer, hellenistischer und römischer Gebäude entdeckt. Von besonderem Interesse ist ein langgestrecktes, gepflastertes, stoisches Gebäude (4.-5. Jh. n. Chr.) im Westen, das aus zwei parallelen Räumen besteht: einem vorderen Raum mit einem marmornen Stylobaten an der offenen Ostseite und einem zweiten, inneren Raum mit einer Türöffnung, die der Kommunikation zwischen den beiden Räumen diente.
Unter den beweglichen Funden treten eine Tonfigur einer Gottheit oder Anbeterin mit vogelförmigem Gesicht und fast zylindrischem Oberkörper (7. Jh. v. Chr.), zwei Tonfiguren von sitzenden Frauengestalten (Ende 6. Jh. v. Chr.), sowie fragmentarisch erhaltene attische schwarzfigurige Vasen mit mythologischen Darstellungen (Hochzeitszug von Zeus-Hera oder Dionysos-Ariadne, Herkules und Amazonen, Artemis und Aktaion.
Das Heiligtum der Kybele in Mytilene zeugt von der herausragenden Bedeutung, die der Kult der Muttergöttin in der nordöstlichen Ägäis als Beschützerin der Stadt, bereits in geometrischer Zeit hatte. Die archäologische Stätte des Heiligtums ist heute dauerhaft für die Öffentlichkeit zugänglich.
